葛剑雄认为，最好不要轻易把一些“发表论文抄袭现象”界定为“学术腐败”。像学生考试作弊，研究生毕业论文发表涉嫌抄袭，教师申报职称时学术成果注水，诸如此类，虽然有的造成了严重的后果，绝不能掉以轻心，但毕竟还属于学术不规范或学风不正的范畴。只有那些对学术界、高校和社会危害最大、影响最恶劣的“学术事件”，才算得上是学术腐败。
学术腐败两大特点：一、必定与权力相结合，利用权力达到在学术上的目的。二、离不开金钱的介入。
在政商两界，像王益这样的博士并不少，有的博士帽得来比王益更为离奇。有的人大字识不了多少，有的人粗俗不堪，说他们中学毕业都不像，但照样能拿到学士、硕士以至博士学位，有的还在媒体大肆宣扬，靠的就是他们的亿万身价和铺路的金钱。
像已被双规的前国家开发银行副行长王益，凭着在中央部门工作多年的资历，到国务院证券办公室任职两年后，就在职戴上了博士帽。王益原是北京大学的历史学硕士，在北京工作，却能攻读千里外的成都一所高校的经济学博士学位，并且顺利发表毕业论文能比正常的全职博士生还提前一年拿到学位，靠的就是手中的权力。湖南某前副省长离校从政时还是讲师，随着官职升到副省级，他的职称论文发表顺利，也提到了教授和博士生导师。他从政期间完成的科研项目和发表的论著，居然比一些以多产著称的专职学者还要多，他不靠权力靠什么？权力在手，不仅能轻易达到学术上的目的，而且还不怕东窗事发。
据报道，广州中医药大学校长徐志伟的博士论文发表，居然与他“指导”并已获得博士学位的学生的论文如出一辙，两位教师实名举报两年，其中一位就是奉命帮他完成这篇论文的人，最近徐志伟不得不当着媒体记者的面，承认他的博士学位论文的确有问题，但以该校名义发表的一个“严正声明”，却依然为徐志伟张目，反诬揭露其丑行的教师。某地主管部门居然下令媒体不得刊登有关此事的报道，彻底暴露了学术腐败的权力靠山。
所以，欲遏制学术腐败，固然需要严厉打击，但更重要的是从制度上堵截权力和金钱对大学的干预。如果大学的学术独立得到法律的保障，如果大学的正常经费得到财政的保证，那么权力和金钱的威力就会相形见绌。
复旦大学社会科学高等研究院院长邓正来教授列举了两组数字：一方面，据教育部的不完全统计，仅“九五”和“十五”期间，中国高校哲学社会科学共发表学术论文300余万篇，出版学术著作30余万部，举办国际学术会议约7000次，参加国际会议20万多人次；而另一方面，在2007年SSCI（社会科学引文索引）收录的1962种期刊中，涉及中国问题和中国研究的期刊只有11种，其中只有两种为中国大陆地区学术机构创办和主持，“这在一定程度上也说明了中国社会科学的国际化水准有待提升”。
多位与会的学术期刊主编认为，近些年国内社科方面的学术论文数量不断增加，但水平却有所下降，尤其是一些学术期刊滥收版面费，同时也降低了对论文水平的要求，导致“水货论文”比比皆是。
“据说自然科学学术期刊收取版面费是国际惯例，可这样的国际惯例在中国有点走样。”《清华大学学报》常务副主编仲伟民直言，版面费的存在是引发学术不端行为的一个重要原因。
而《学术月刊》主编田卫平则梳理出一个学术论文的利益链条：学术期刊缺少经费——收取版面费——编辑部建立“小金库”——增加版面，季刊改成双月刊，双月刊改成月刊，月刊改成半月刊，还不时“增刊”——论文公司应运而生——枪手操刀，论文质量下降。
田卫平告诉记者，目前国内的学术期刊对待来稿大致有5种情况：一是不收版面费，还给稿费；二是有些文章给稿费，有些文章不给稿费；三是不收版面费，也不给稿费；四是有些文章给稿费，有些文章收版面费；五是所有文章都收版面费
